Najstarší kostolík z roku 1208 bol poškodený, neskôr postavený nový okolo 1340, s použitím materiálu so starého kostola. Patrocínium Sv. Kozma a Damiána sa najčastejšie používali v ranogotickom období( Kšinná, Sedliacka Dubová na Orave). Kostol bol založený nitrianskym biskupstvom.
Prvá písomná zmienka o farnosti z roku 1410, spomína sa farár Michal.
Fresky typické pre gotické kostoly – Motív Deesis – príhovor Panny Márie a sv. Jána Krstiteľa u Nebeského Otca – archanjel Michal ako váži na váhach duše prichádzajúce do večnosti. Gotické maľby možno zaradiť do okruhu Taliansko – byzantskej orientácie.
Obraz Sv. Kozmu a Damiána je z roku 1730 – to už sú barokové prvky.
Je zachovaná vizitácia z roku 1675. Zistilo sa v nej, že niekdajší farský kostol bol zničený ohňom, podobne aj fara pri kostole. V tom roku kostol priradili pod právomoc farára v Trenčíne a Biskupice sa od roku 1675 stávajú súčasťou farnosti Trenčín. Aj neskoršie vizitácie z 1730 a 1760 a 1800 spomínajú kostola v Biskupiciach ako filiálny kostol farnosti Trenčín.
V novodobej histórii Vojtech Hromník bol správcom kostola sv. Anny a kostola v Biskupiciach od roku 1950 až do roku 1997